Program Studi Magister Teologi Kristen Protestan

Progran Studi Magister TKP telah menghasilkan banyak lulusan yang mengabdi bukan saja di Maluku tetapi juga di wilayah lain di Indonesia, seperti Papua dan Maluku Utara. Mayoritas lulusan magister TKP mengabdi sebagai pendeta di GPM.  Sekalipun demikian program studi magister TKP ini bersifat lintas denominasi dan aliran gereja. Kesadaran kemajemukan menjadi salah satu nilai yang diperjuangkan oleh program studi ini. Karena itu, kerjasama dengan IAIN Ambon terus dikembangkan, baik dalam proses perkuliahan maupun pembimbingan  penulisan tesis mahasiswa.